Characterising the regulatory mechanisms at decoy 5’ splice sites
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Masarykova univerzita / Lékařská fakulta
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
24-11219K
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace regulačních mechanizmů sestřihu mRNA ve skrytých donorových místech sestřihu
Annotation in Czech
V posledních letech se ukázalo, že kryptická místa sestřihu mohou hrát důležitou roli při regulaci sestřihu RNA, a zprostředkovaně i celé genové exprese. Mnoho takových regulačních míst je třeba ještě objevit a prozkoumat mechanismy jejich působení. Tento projekt je zaměřen na tzv. decoy 5' sestřihová místa (d-5'ss). Ta obsahují konsenzuální sekvenci 5' sestřihových míst a umožňují sestavení spliceosomu. Budou zkoumány dva hypotetické způsoby jejich působení. Pokusíme se určit podíl d-5'ss, které sestavují neproduktivní spliceozomální komplexy, které soutěží s rozpoznáváním blízkých kanonických sestřihových míst a zpomalují jejich sestřih. Zadruhé určíme typy d-5'ss, které jsou štěpeny prostřednictvím sestřihové reakce, ale výsledná RNA je poté degradována. V poslední řadě budeme zkoumat vliv reprezentativních d-5'ss na dynamiku exprese a lokalizaci transkriptů produkovaných z odpovídajících genů během diferenciace neuronů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GF-R
Data delivery date
Mar 29, 2024
Finance
Total approved costs
8,364 thou. CZK
Public financial support
8,329 thou. CZK
Other public sources
35 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK