Dark matter in plant cell nuclei – characterization of nuclear proteins
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta<br>Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-28443S
Alternative language
Project name in Czech
Temná hmota jádra rostlinné buňky – charakterizace jaderných proteinů
Annotation in Czech
Většina genetické informace eukaryot je uložená v buněčných jádrech, vysoce organizovaných a dynamických organelách. U člověka a některých modelových organismů byly popsány mnohé proteiny hrající důležitou roli v uspořádání DNA v chromatinu, její replikaci a transkripci v jádrech. To kontrastuje se situací u rostlin, kde nemáme téměř žádné informace o většině těchto proteinů. To připomíná temnou hmotu ve vesmíru, jejíž existence je obecně přijímána, ale její podstata zůstává nejasná. S cílem odhalit důležité součásti buněčných jader rostlin a objevit dosud necharakterizované proteiny a jejich možné interaktory, plánujeme využití multidisciplinárních přístupů, včetně proteomiky, průtokové cytometrie a imunohistochemie. Mimo identifikaci nových proteinů budeme provádět také lokalizační analýzu vybraných proteinů a sledovat změny proteinového složení jader v průběhu buněčného cyklu. Výsledky budou sloužit k objasnění charakteru a funkce významné složky jader rostlinných buněk.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project combined flow cytometry to sort plant nuclei at different cell cycle phases followed by protemics analysis. There were identified almost 2500 nuclear proteins specific for different cell cycle phases or mitotic chromosomes; the proteins were made publicly available in UNcleProt database. The results were so far summarized in three papers in impacted journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
8,356 thou. CZK
Public financial support
8,356 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK