Nucleic Acid Regulatory Sequences - polymorphism, dynamics, and interactions
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.<br>Univerzita Karlova / Matematicko-fyzikální fakulta<br>Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-06785S
Alternative language
Project name in Czech
Regulační úseky nukleových kyselin - polymorfismus, dynamika a interakce
Annotation in Czech
Projekt je zaměřený na detailní studium strukturního uspořádání, tvorby biologicky relevantních komplexů a dynamiky vybraných reprezentativních typů regulačních úseků nukleových kyselin - DNA guaninových kvadruplexů, sekvencí miRNA a DNA transkripčních elementů obsahujících CArG box - pro objasnění molekulárního mechanismu jejich regulační funkce a jejího ovlivňování externími faktory, jmenovitě molekulárním crowdingem, teplotou a molekulárním okolím zabezpečujícím nábojovou kompenzaci. Úseky nukleových kyselin, případně jejich komplexy s klíčovými proteiny, budou studovány metodami SPR biosenzoru, Ramanovy a NMR spektroskopie, CD spektroskopie, Ramanovy optické aktivity a molekulárně-dynamických simulací.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The objectives have been achieved. The original findings regarding the structural arrangement and dynamics of nucleic acids were obtained. The outcomes are competitive at the international level. Also new methodical procedures were developed. The results were published in 8 journal articles. The funds were used effectively.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 27, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
11,631 thou. CZK
Public financial support
11,631 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK