All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Formation and dynamics of nucleic acid motifs involved in regulation of gene expression

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)

  • Main participants

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    202-09-0193

Alternative language

  • Project name in Czech

    Vznik a dynamika strukturních motivů nukleových kyselin podílejících se na regulaci genové exprese

  • Annotation in Czech

    Projekt se zabývá vlastnostmi důležitých úseků nukleových kyselin (NA) z hlediska jejich strukturních fluktuací a kinetiky tvorby a zániku strukturních útvarů, případně jejich komplexů. Hlavní důraz bude kladen na použití široké škály pokročilých experimentálních technik včetně mikro-Ramanovy spektroskopie, senzorů na bázi rezonance povrchových plasmonů (SPR) a dynamických NMR měření na 13C-značených nukleotidech, doplněných molekulárně-dynamickými simulacemi. Výzkum bude zaměřen na několik skupin NA strukturních motivů významných pro přirozenou či uměle řízenou regulaci genové exprese. Kromě důkladného porozumění strukturním a dynamickým vlastnostem přirozených i chemicky modifikovaných NA strukturních motivů dojde i k rozvoji určitých experimentálních technik, konkrétně k vývoji směšovacího mikrofluidního systému pro mikro-Ramanova měření a k implementaci nové koncepce SPR snímání s polarizačním kontrastem pro vysoce paralelizovaná měření.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    BO - Biophysics

  • CEP - secondary branch

    BH - Optics, masers and lasers

  • CEP - another secondary branch

    CC - Organic chemistry

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10306 - Optics (including laser optics and quantum optics)<br>10401 - Organic chemistry<br>10610 - Biophysics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

  • Project results evaluation

    The project objectives were met, interesting results have been obtained in the study of structure, dynamics and interactions of structural motifs of nucleic acids (NA), which are important for gene expression. Study results were published in 30 publications in high quality journals. Financial management was in accordance with the rules and conditions.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2009

  • Realization period - end

    Dec 31, 2013

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Jun 12, 2013

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP14-GA0-GA-U/01:1

  • Data delivery date

    Jul 1, 2014

Finance

  • Total approved costs

    12,186 thou. CZK

  • Public financial support

    12,186 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK