Formation and dynamics of nucleic acid motifs involved in regulation of gene expression
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
202-09-0193
Alternative language
Project name in Czech
Vznik a dynamika strukturních motivů nukleových kyselin podílejících se na regulaci genové exprese
Annotation in Czech
Projekt se zabývá vlastnostmi důležitých úseků nukleových kyselin (NA) z hlediska jejich strukturních fluktuací a kinetiky tvorby a zániku strukturních útvarů, případně jejich komplexů. Hlavní důraz bude kladen na použití široké škály pokročilých experimentálních technik včetně mikro-Ramanovy spektroskopie, senzorů na bázi rezonance povrchových plasmonů (SPR) a dynamických NMR měření na 13C-značených nukleotidech, doplněných molekulárně-dynamickými simulacemi. Výzkum bude zaměřen na několik skupin NA strukturních motivů významných pro přirozenou či uměle řízenou regulaci genové exprese. Kromě důkladného porozumění strukturním a dynamickým vlastnostem přirozených i chemicky modifikovaných NA strukturních motivů dojde i k rozvoji určitých experimentálních technik, konkrétně k vývoji směšovacího mikrofluidního systému pro mikro-Ramanova měření a k implementaci nové koncepce SPR snímání s polarizačním kontrastem pro vysoce paralelizovaná měření.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
BH - Optics, masers and lasers
CEP - another secondary branch
CC - Organic chemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10306 - Optics (including laser optics and quantum optics)<br>10401 - Organic chemistry<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project objectives were met, interesting results have been obtained in the study of structure, dynamics and interactions of structural motifs of nucleic acids (NA), which are important for gene expression. Study results were published in 30 publications in high quality journals. Financial management was in accordance with the rules and conditions.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 12, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
12,186 thou. CZK
Public financial support
12,186 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK