Novel reactive groups introduced in nucleic acids for modification with oxoosmium complexes: structural and analytical aspects
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.<br>Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-08434S
Alternative language
Project name in Czech
Nové reaktivní skupiny zavedené do nukleových kyselin pro modifikaci oxokomplexy osmia: strukturní a analytické aspekty
Annotation in Czech
Budou připraveny nukleové kyseliny (NK) obsahující syntetické deriváty nukleobazí nesoucí reaktivní skupiny potřebné k tvorbě osmiových aduktů stabilizovaných dusíkatými ligandy při reakci s oxidem osmičelým (reagujícím s nenasycenými C-C vazbami) nebo s osmianem draselným (reagujícím s cis-1,2 dioly). Tyto nové reaktivní skupiny zahrnují 7-deazapuriny, 5,6-dihydroxydihydropyrimidiny a konjugáty nukleobazí s externími substituenty (v poloze C5 u pyrimidinů nebo C7 u 7-deazapurinů) prezentujícími výše zmíněné reaktivní skupiny. Modifikace takto funkcionalizovaných NK osmiovými činidly bude studována s ohledem na typ zavedených reaktivních skupin, strukturu NK, typ stabilizujícího ligandu a další podmínky. Elektrochemické vlastnosti aduktů osmia s NK budou detailně studovány za účelem vývoje jednoduchých bioanalytických metod založených na značení NK sloučeninami osmia, aplikovatelných při studiu interakcí NK s proteiny nebo malými molekulami ovlivňujícími strukturu NK, při detekci produktů oxidativního poškození DNA a pro další účely.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - secondary branch
CG - Electrochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10406 - Analytical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Nukleobases modified by alkenes, alkynes, diols, sugars were prepared and subsequently incorporated into the DNA structure. Functional groups introduced were proved to react with oxoosmium complexes forming electroactive adducts. This feature might be used for electrochemical detection of DNA interactions or damage. However, applications have not been developed yet. Results published as 2 papers.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Apr 25, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 2, 2020
Finance
Total approved costs
7,935 thou. CZK
Public financial support
7,935 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK