Phosphoinositide compartments in the cell nucleus: structure and function
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-08738S
Alternative language
Project name in Czech
Fosfoinositidové kompartmenty v buněčném jádře: struktura a funkce
Annotation in Czech
DNA transkripce je kriticky závislá na prostorovém uspořádání uvnitř jádra. Přestože hodně je známo o interakcích mezi proteiny a DNA, příspěvek lipidů k udržení organizace uvnitř jádra je zatím nejasný. V předchozí práci jsme ukázali, že fosfatidylinositol 4,5-bisfosfát (PI(4,5)P2), člen skupiny fosfoinositidů (PIs), podporuje transkripci rDNA a navíc i přispívá k zachování struktury jadérka. V tomto projektu plánujeme detailně zmapovat lokalizaci různých PIs v nukleoplazmě a identifikujeme jejich vazebné partnery. Naše předběžná data ukazují, že PI(4,5)P2 se lokalizuje do oddělených ohnisek. Budeme analyzovat jejich molekulové složení a také jejich roli v jaderných procesech s důrazem na transkripci. Plánumeme také objasnit komunikaci mezi jednotlivými PIs a porovnat jejich distribuci v různých buněčných liniích, tkáních a různých stadiích buněčného cyklu. Z výsledků vyplývá, že PIs tvoří nové jaderné kompartmenty, které ovlivňují složení genomu a tím i transkripci DNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
These findings describe new lipid structures in the nucleus - lipid islets that are most likely involved in gene expression and transcription of genes. They are the basis for further research in this area and can become a potential target of pharmacological manipulation of gene expression processes. Results have been published in 5 impacted papers and are an important contribution to biomedicine.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
9,918 thou. CZK
Public financial support
9,918 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK