Functional modulation of chromatin-modifying enzymes by nuclear phosphoinositides
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-09103S
Alternative language
Project name in Czech
Regulace funkce chromatin-modifikujících enzymů jadernými fosfoinositidy
Annotation in Czech
Chromatinové modifikace jako metylace a acetylace histonů jsou klíčové pro regulaci genové exprese. Přestože je hodně známo o funkci chromatin asociovaných proteinů, role fosfoinositidů v tomto procesu je nedostatečně prozkoumána. V předchozí práci jsme ukázali, že fosfatidylinositol 4,5-bisfosfát (PI(4,5)P2), člen skupiny fosfoinositidů, asociuje s transkripčním faktorem UBF, podporuje aktivitu RNA polymerázy I a stimuluje rDNA transkripci. V tomto projektu se zaměříme na roli fosfoinositidů v epigenetické regulaci transkripce a zárodečného vývoje. Plánujeme identifikovat chromatin modifikující enzymy, které interagují s jadernými fosfoinositidy. Konkrétně, naše predběžné výsledky ukazují, že PI(4,5)P2 interaguje s histon demetylázami PHF8 a LSD1. Budeme proto zjišťovat, jaká je role fosfoinositidů v těchto chromatin modifikujích komplexech, a to v buňkách tkánových kultur i během vývoje C. elegans. Tyto výsledky poskytnou nový pohled na molekulární mechanismy epigenetické regulace genové exprese.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The findings of the project, presented in the attached publications, describe the interaction of chromatin-modifying enzymes (eg PHF8 demethylase) with nuclear phosphoinositides. The function of nuclear phosphoinositides in the development of C. elegans was characterized. The results contributed to a better understanding of the role of phosphoinositides in gene regulation.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 10, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
Jul 23, 2020
Finance
Total approved costs
9,384 thou. CZK
Public financial support
8,589 thou. CZK
Other public sources
795 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK