Development of theoretical and spectroscopic tools for studies of amyloid fibrils
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-09072S
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj teoretických a spektroskopických nástrojů pro studium amyloidních fibril
Annotation in Czech
Fibrilární struktury peptidů a proteinů přitahují pozornost pro jejich mnohé a často neznámé funkce v živých organismech, týkající se zejména degenerativních chorob nervové soustavy (např. Alzheimerova, Parkinsonova, Huntingtonova). Optické spektroskopické metody poskytují unikátní možnosti pro sledování a analýzu těchto agregátů. Velkou překážkou je ale omezená rozpustnost a velikost těchto systémů. V projetu zlepšíme teoretické a experimentální postupy, které umožní širší užití spektroskopických metod pro studie těchto supramolekul. Zaměříme se na adaptaci kvantově-chemických metod pro větší systémy, a měření sraženin pomocí vibrační optické aktivity. Počítačové simulace také poskytnou vztah mezi tvarem spektra a strukturou. Dlouhodobým cílem je znalost mechanismu sbalování proteinů, která přispěje k diagnostice a léčbě nemocí spojených s konformačním chováním proteinů. Projektu se účastní tři zkušení výzkumníci a dva PhD studenti. Předpokládá se také spolupráce s domácími i zahraničními laboratořemi.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project was devoted to the interpretation of the Raman optical activity (ROA) spectra recorded for fibrillar protein structures. Novel experimental and theoretical approaches were designed to identify, describe and investigate these structures. All the project aims were fulfilled leading to 12 published articles and 1 book chapter. High engagement of students is also beneficial.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
3,616 thou. CZK
Public financial support
3,616 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK