New imaging and spectroscopic methods for biological studies
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D
Call for proposals
—
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
MSMT-21343/2019-2
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj nových zobrazovacích a spektroskopických metod pro biologické studie
Annotation in Czech
Dlouhodobým cílem projektu je vývoj nových spektroskopických a zobrazovacích procedur vhodných pro chirální biomolekuly. Zaměříme se na proteinové fibrily a karotenoidové agregáty. Dojde tak k podstatnému rozšíření stávající spolupráce mezi vědeckými skupinami na Ústavu organické chemie a biochemie, AVČR v Praze a Fakultě chemie Jagellonské univerzity v Krakově v oboru biomolekulární spektroskopie a zobrazování. Plánujeme zejména nalézt spojení mezi strukturou proteinových fibril a jejich spektry. Chceme pochopit jejich formování, prozkoumáme možnosti rozlišení jejich různých typů a použití pro diagnózu chorob spojených s konformačními změnami proteinů. Nově využijeme spektrometr Ramanovy optické aktivity pro měření cirkulárně polarizované luminiscence a vyvineme lanthanoidové komplexy sloužící jako sondy k průzkumu interakcí proteinů pomocí této metodologie. V případě deoxyribonukleových kyselin spojíme chiroptickou spektroskopii (převážně VOA) se zobrazováním jejich struktur pomocí mikroskopických metod (Raman, konfokální, fázový kontrast, AFM). Dalším cílem tak bude osvětlení vztahu VOA spekter ke struktuře agregátů. Bude vyvinut teoretický model na základě kvantových výpočtů. Získané výsledky také napomohou porozumění supramolekulárnímu sebeuspořádání DNA v buňkách. Určíme zdroje zesílení VOA v případě karetoniodových agregátů. Využijeme ho k určení struktury těchto systémů. Kombinace molekulárně dynamických a kvantově chemických simulací nám pomůže porozumět tomuto fenoménu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10610 - Biophysics
OECD FORD - secondary branch
10403 - Physical chemistry
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
BO - Biophysics<br>CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project was implemented within the framework of the MOBILITY Activity, whose main objective is to establish and deepen contacts with foreign research institutions. Therefore, the partial outputs of the project are not evaluated by the evaluation committee, but the correctness and adequacy of the use of the provided funds are checked.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 5, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-8J-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
141 thou. CZK
Public financial support
141 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK