Validation and Interpretation of Modulated Structures
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Fyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-12653S
Alternative language
Project name in Czech
Validace a interpretace modulovaných struktur
Annotation in Czech
Modulované krystaly se vyznačují porušením trojrozměrné translační symetrie. Jejich struktury jsou počítány metodami programu JANA2006. Podle našich odhadů se vědci během stoleté existence krystalografie setkali se zhruba šesti tisíci modulovanými strukturami. V důsledku technických omezení, náročnosti metod a nedostatku interpretačních nástrojů z nich však byla plně vyřešena a publikována pouze část. Náš projekt se zabývá validací a interpretací (3+1)-rozměrných modulovaných struktur. Budou vyvinuty snadno použitelné nástroje pro manipulaci, validaci a vizualizaci modulovaných CIF souborů, nástroje pro rozbor čtyřrozměrných Fourierových map a dále prostředky pro průzkum geometrie modulovaných struktur včetně nevazebných interakcí. Chyby v určení struktury budou přehledně indikovány pomocí tzv. alertů. Navrhované prostředky interpretace a validace budou začleněny do programu JANA2006 a propojeny s databázi modulovaných struktur v Bilbau. Usnadněním práce autorů i editorů dosáhneme lepšího poměru publikovaných a odložených modulovaných struktur.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - secondary branch
CC - Organic chemistry
CEP - another secondary branch
CA - Inorganic chemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10402 - Inorganic and nuclear chemistry<br>10406 - Analytical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The main aim of the project: implementation of new functionalities (e.g. Data checker, CIF wizard, De Wolff spider, visualization of twins) into crystallographic package Jana2006. The outputs of the projects: more than 30 publications with the crystallographic part created using Jana2006. Part of the travel was spent on training of new users of Jana2006.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
6,258 thou. CZK
Public financial support
6,258 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK