Crystallography21 - New generation of universal tools for structure analysis from diffraction data
Project goals
Our goal is to create a universal crystallographic toolbox, applicable for the most demanding tasks of modern crystallography, yet at the same time furnished with the most intuitive user interface. The development will start from the widely used universal crystallographic program JANA2006. The intuitive graphics-driven user control will be based on a new plotter of crystal structures. The user, while editing structure parameters by clicking on visualized parts of the crystal structure, will be able to see immediately the changes of the crystal structure or residual density during refinement cycles. The existing tools of JANA2006 will be improved and extended by indexing tool for powder diffraction data, graphical editing of modulation functions, and full support for higher-dimensional nuclear and magnetic structures. The resulting software, JANA2020, with a complete undo/redo system and possibility to switch between the basic and advanced modes, will facilitate all tasks of modern structure analysis, and will be especially useful for intuitive analysis of modulated structures.
Keywords
crystal structure analysiscrystallographymodulated structuresmagnetic structureselectron densitiescomputing methods
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Fyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-10504S
Alternative language
Project name in Czech
Krystalografie21 - nová generace univerzálních nástrojů strukturní analýzy z difrakčních dat
Annotation in Czech
Naším cílem je vyvinout sadu univerzálních krystalografických nástrojů aplikovatelných na nejnáročnější úlohy současné krystalografie a vybavených moderním intuitivním uživatelským rozhraním. Vývoj založíme na široce užívaném universálním krystalografickém programu JANA2006. Intuitivní uživatelské rozhraní bude založeno na novém nástroji pro visualizaci krystalových struktur. Uživatel bude editovat strukturní parametry kliknutím na části zobrazené struktury, a nástroj bude bezprostředně zobrazovat změny struktury a zbytkové elektronové hustoty v důsledku strukturního upřesňování. Dosavadní nástroje programu JANA2006 budou zdokonaleny a rozšířeny o indexaci práškového záznamu, grafickou editaci modulačních funkcí a plnou podporu vícedimenzionálních atomárních a magnetických struktur. Výsledný program, JANA2020, s kompletním systémem historie změn a možností přepínání mezi základním a pokročilým režimem, usnadní veškeré úlohy moderní strukturní analýzy a bude mimořádně užitečný pro intuitivní analýzu modulovaných struktur.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Apr 24, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
6,131 thou. CZK
Public financial support
5,521 thou. CZK
Other public sources
610 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
6 131 CZK thou.
Public support
5 521 CZK thou.
90%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Analytical chemistry
Solution period
01. 01. 2018 - 31. 12. 2023