Molecular basis of substrate recognition by histone deacetylase 6.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-19640S
Alternative language
Project name in Czech
Substrátová specifita histon deacetylasy 6 na molekulární úrovni.
Annotation in Czech
Acetylace proteinů se ukazuje být klíčovým regulačním mechanismem základních buněčných procesů a její rozsah a význam se vyrovná ostatním posttranslačním modifikacím, jako např. fosforylaci. Histon deacetylasa 6 (HDAC6) je strukturně a funkčně unikátní proteinová deacetylasa a představuje lákavý cíl terapeutických zásahů u nádorových onemocnění a neuropatologií. Pochopení fyziologických funkcí HDAC6 ovšem brání skutečnost, že doposud bylo identifikováno pouze několik fyziologických substrátů HDAC6. Grantový návrh je zaměřen na objasnění molekulárních mechanizmů substrátové specifity tohoto enzymu, se zvláštním důrazem na interakci s tubulinem. Uspěšně jsme zavedli metodiku pro heterologní produkci variant HDAC6, která bude využita společně s acetylomovými mikročipy a peptidovými knihovnami k identifikaci nových substrátů pro HDAC6. Ke stanovení základních principů ovlivňujících rozpoznávání tubulinu a mikrotubulů molekulou HDAC6 bude využita série biochemických a biofyzikálních metod.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Presented results clearly show that aims were achieved. Results are applicable even at different fields and methodology is transferable There are 9 papers in impacted journals of above average impact factors There are no discrepancies or misspending neither violation of GACR rules.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Nov 29, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 2, 2020
Finance
Total approved costs
6,852 thou. CZK
Public financial support
6,852 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK