Analysis of Rous sarcoma virus replication blocks in non-permissive cells and characterization of factors contributing to virus rescue
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-22207S
Alternative language
Project name in Czech
Analýza replikačních bloků viru Rousova sarkomu v nepermisivních buňkách a určení faktorů přispívajících ke spuštění virové produkce
Annotation in Czech
Jednou ze současných priorit ve virologii obecně a retrovirologii obzvlášť je porozumět tomu, které buněčné faktory se účastní kontroly horizontálního šíření virů. Nedávno jsme popsali na molekulární úrovni, které bloky při virové replikaci pozorujeme v nepermisivích křeččích buňkách transformovaných ptačím virem Rousova sarkomu (RSV) a jaké změny nastanou při spuštění virové produkce po fúzi s permisivní kuřecí buňkou. V této aplikaci navrhujeme pokračovat ve studiu obnovení virové produkce s důrazem na popis, jaká omezení pozorujeme u buněk různých ptačích druhů ve schopnosti spustit virovou produkci ze savčích buněk. Nicméně našim hlavním cílem je určit, které kuřecí faktory přispívají ke spuštění virové produkce v savčích buňkách. V této souvislosti navrhujeme dva různé přístupy. První z nich je založen na studiu RSV regulačních RNA elementů a nalezení proteinů, které se na ně vážou. Druhý z nich využívá radiačních hybridů kuře-křeček, pomocí nichž chceme zjistit, které části kuřecího genomu jsou nutné k překonání popsaných bloků při replikaci RSV v nepermisivních buňkách.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The main contribution of outcomes of the current project is the setup of a model for studying interspecies transfer of envelopped viruses. This is a new concept that can be used for study of newly emerging viral infections. Publication activity was 3 articles with IF (two reviews). Participation of students resulted in their authorship in the PNAS article. The rules of CSF were respected.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
6,823 thou. CZK
Public financial support
6,823 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK