Genomic study of adaptive population shifts in response to climate change
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-03248S
Alternative language
Project name in Czech
Genomická studie adaptivních změn rozšíření populací v odpovědi na klimatické změny
Annotation in Czech
Současné rozšíření živočišných druhů je z velké části výsledkem kolonizace během oteplení na konci poslední doby ledové. Dlouhou dobu se předpokládalo, že populace obývající určitá území Evropy jsou těmi populacemi, které to území kolonizovaly jako první. Nové výzkumy však ukázaly, že v některých případech byla první příchozí populace nahrazena jinou, později příchozí a pocházející z jiného glaciálního refugia. Navrhujeme proto s použitím nové metody genotypování tisíců markerů SNP, skríningu fyziologicky důležité mutace hemoglobinu a modelování ekologických nik otestovat, jestli k takovému nahrazení populací došlo při postglaciální kolonizaci Evropy norníkem rudým a jakou úlohu při tom sehrály adaptivní rozdíly mezi populacemi. V případě, že hlavním určujícím faktorem postglaciálního rozšíření populací je adaptace a selekce, budou mít takové výsledky klíčový význam pro porozumění změnám rozšíření druhů v průběhu současných i budoucích klimatických změn.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project fulfiled all three proposed aims. For each of them it yielded novel data and resulted in three published studies in high quality journals. The most important findings were confirmation of population replacement of bank vole, documented introduction of benificial mutation in hemoglobin, and modelling of niche diversification during the recolonisation of Europe from different refugia.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
5,937 thou. CZK
Public financial support
5,253 thou. CZK
Other public sources
684 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK