Genomic study of a climate-driven population replacement
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT II
Call for proposals
KONTAKT II 5 (SMSM2015LH5)
Main participants
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT- 32267/2015-1
Alternative language
Project name in Czech
Genomická studie populační výměny způsobené změnou klimatu
Annotation in Czech
Základním cílem projektu bude otestování hypotézy, že k podobnému, změnou klimatu vyvolanému, nahrazení jedné populace norníka rudého druhou jako v Británii došlo i v jiných částech Evropy, konkrétně při kolonizaci Skandinávie. S využitím nejmodernějších metod populační genomiky projekt odpoví na následující otázky: (1) Došlo při kolonizaci Skandinávie během postupného oteplování na konci doby ledové k nahrazení genomu jedné populace genomem druhé? (2) Pokud ano, existují mezi oběma kolonizujícími populacemi podobné adaptivní rozdíly ve schopnosti odolávat oxidačnímu stresu jako v případě britských norníků? (3) Mají první kolonisté Británie a Skandinávie původ ve stejném „severním“ refugiu, což mohlo být příčinou jejich časné expanze?
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Using different markers (genomic SNPs, mtDNA) we demonstrated population replacement during colonisation of Great Britain and Scandinavia after the last ice age and described the evolution and importance of an adaptive haemoglobin mutation. All aims were achieved. Results were published and presented at conferences, workshops and scientific institutions, and will form the basis of a dissertation.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 4, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 2, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-MSM-LH-U/01:1
Data delivery date
Jun 7, 2018
Finance
Total approved costs
1,942 thou. CZK
Public financial support
1,942 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK