Supramolecular chirality of nucleic acids
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-04902S
Alternative language
Project name in Czech
Supramolekulární chiralita nukleových kyselin
Annotation in Czech
Supramolekulární chiralita má původ v chirálním uspořádání molekul do supramolekulárních agregátů a způsobuje výrazné zesílení signálu cirkulárního dichroismu. Chiroptické metody (elektronický cirkulární dichroismus (ECD), vibrační cirkulární dichroismus (VCD) a Ramanova optická aktivita (ROA)) jsou ideální metody pro studium těchto systémů. Přesto jenom ECD technika byly v minulosti použita k tomuto účelu. Dosud neexistuje univerzální teoretický model vysvětlující pozorované zesílení CD signálu. Proto navrhujeme kombinovaný experimentální a teoretický přístup pro studium supramolekulární chirality nukleových kyselin. VCD a ROA spectroskopie budou přizpůsobeny a použity ke studiu vysoce koncentrovaných vzorků DNA. Experimentální výsledky budou interpretovány na základě moderních vícestupňových výpočetních postupů. Molekulární dynamické simulace budou kombinovány s výpočty spekter na základě teorie elektronové hustoty. Tato technologie umožní určit vztah mezi spektry a strukturou. Výsledky bude možné použít v strukturních studiích biologických molekul a objektů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Theoretical methodologies for calculations of spectral parameters of large nucleic acid systems were developed and fine -tuned in agreement with the project proposal. Postgraduate and high school students participated. Project was very successfully presented at conferences. Four papers in impacted international scientific journals and a manuscript under revision are excellent outcomes.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
2,674 thou. CZK
Public financial support
2,428 thou. CZK
Other public sources
246 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK