Control of hotspots of meiotic double-strand DNA breaks in Rattus norvegicus
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-06548S
Alternative language
Project name in Czech
Kontrola umístění dvouřetězcových zlomů DNA v meióze laboratorního potkana
Annotation in Czech
Místa, kde dochází v meióze ke dvouřetězcovým zlomům DNA a tedy i místa genetické rekombinace, jsou determinována proteinem PRDM9 (PR/SET-domain carrying 9), epigenetickým faktorem, jenž katalyzuje methylaci histonu 3 na lysinu 4. Tento protein je nezbytný pro plodnost laboratorní myši ale ne psa. Některé ne však všechny myši heterozygotní pro určité mutace Prdm9 genu jsou neplodné, ale není známo, zda jsou tyto rozdíly ve fertilitě způsobené variacemi v Prdm9 mutacích nebo v genetickém pozadí. Existují neplodní pacienti, kteří nesou heterozygotní mutace v lidském PRDM9 genu, ale neví se, zda jsou tyto mutace příčinami sterility. Připravili jsme linie nesoucí čtyři různé delece v exonu kódujícím PR/SET katalytickou doménu genu Prdm9 potkana a získali tak jedinečnou příležitost k analýze genomového rozložení meiotických zlomů DNA ale i fertility potkanů heterozygotních a homozygotních pro Prdm9 mutace. Tyto analýzy nám navíc umožní cíleně řídit genetickou rekombinaci u potkana.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This project analysed the distribution of meiotic breaks of DNA and recombination and their relationship to fertility in rat. Results support hypotheses on influence of Prdm9 factor on fertility through the relocation of meiotic recombination sites and on the fact that Prdm9 elicits a sex-specific effect on fertility.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 11, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 24, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/06:1
Data delivery date
Jun 30, 2021
Finance
Total approved costs
8,727 thou. CZK
Public financial support
8,274 thou. CZK
Other public sources
453 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK