The role of PRDM9-mediated synapsis of meiotic chromosomes in hybrid sterility
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202000001
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-04075S
Alternative language
Project name in Czech
Úloha PRDM9 zprostředkované synapse meiotických chromozomů v hybridní sterilitě
Annotation in Czech
S využitím laboratorních kmenů myší jako modelu jsme identifikovali Prdm9 jako první gen hybridní sterility u obratlovců. Tento model hybridní sterility se osvědčil pro svoji robusnost a reproducibilitu, ale jeho uplatnění v reprodukční izolaci mezi přírodními populacemi zůstalo nejasné. Z tohoto důvodu bude v rámci projektu ověřena role Prdm9 v meiotické rekombinaci, chromozomálním párování a fertilitě hybridů divokých myší se sekvenovanými ZnF doménami Prdm9 genu a geneticky upravenými laboratorními myšmi. Zhoršená synapse homologních chromozomů v meioze sterilních hybridů je vysvětlována jako důsledek asymetrické eroze PRDM9 DNA vazebných míst. Jako zobecnění této hypotézy postulujeme antirekombinační působení mismatch repair genů v mechanismu chromozomální asynapse a hybridní sterility. Idea bude ověřena na nově připravených hybridech s delecemi Msh2 a Msh6 MMR genů. V rámci pozičního klonování Hstx2 lokusu, který interaguje s Prdm9 budeme studovat jeho strukturu pomocí optického mapování genomu a vliv Hstx2 na mRNA a miRNA expresní profil pomocí RNA-seq.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project was aimed at elucidating the role of the Prdm9 gene in reproductive isolation among natural populations of hybrid mice. Important results include elucidation of the molecular mechanism of hybrid sterility driven by Prdm9, description of its genic and chromosomal components and confirmation of its independence from genetic background. Four articles were published (2 in top journals).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 12, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-U
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
10,811 thou. CZK
Public financial support
10,568 thou. CZK
Other public sources
243 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK