Oxidative stress in denitrifying bacteria: deciphering functions of involved proteins and possible environmental impacts
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-18476S
Alternative language
Project name in Czech
Oxidační stres u denitrifikačních baktérií: objasnění funkce zúčastněných proteinů a možných dopadů na životní prostředí
Annotation in Czech
Proteomická studie odezvy bakterie Paracoccus denitrificans na oxidační stres vyvolaný methylviologenem poskytla důležité východisko pro další zkoumání funkce identifikovaných klíčových proteinů. Nový projekt se soustředí na dva proteiny s aktivitou flavinreduktasy, čtyři předpokládané flavin-dependentní monooxygenasy, enzymy fixace CO2 a na proteiny, jejichž indukce je řízena na kyslík/superoxid citlivým transkripčním faktorem FnrP. Kombinací biochemických a molekulárně biologických přístupů budou řešeny otázky: Jaké jsou substráty (přirozené či umělé) nových monooxygenas? Interagují tyto enzymy fyzicky s inducibilními flavinreduktasami? Je syntéza enzymů fixace CO2 řízena systémem RegBA, který by působil jako senzor pro superoxid? Jaké jsou širší dopady oxidativní modifikace FnrP na bakteriální denitrifikaci jako významnou součást globálního cyklu dusíku?
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The major aim of the project was to characterize flavin reductase and putative monooxygenase and to identify its interaction partners, and to elucidate the effect of oxidative stress on bacterial respiratory chain. Although the investigators found out that the gene Pden_5119 to be an NADH oxidase rather than a flavin reductase, its inactivation increased susceptibility to oxidative stress.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 11, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Apr 12, 2021
Finance
Total approved costs
3,946 thou. CZK
Public financial support
2,965 thou. CZK
Other public sources
981 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK