Novel flavin-dependent enzymes of Paracoccus denitrificans: reaction mechanisms, metabolic functions and their role in cellular oxidative stress
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P503-12-0369
Alternative language
Project name in Czech
Nové flavin-dependentní enzymy Paracoccus denitrificans: reakční mechanismy, metabolické funkce a úloha v buněčném oxidačním stresu
Annotation in Czech
Projekt se zabývá dvěma enzymy, flavin reduktasou FerA a chinonreduktasou FerB, spojenými s generováním nebo zvládáním oxidačního stresu u bakterie Paracoccus denitrificans, často nazývané “volně žijící mitochondrie”. Bude izolován gen pro FerA a připravený odpovídající rekombinantní protein bude charakterizován enzymologicky, krystalograficky a pomocí místně řízené mutageneze. Bude stanoveno, zda FerA působí samostatně nebo v kombinaci s dalšími proteiny. V pokusech in vitro bude kvantifikována produkce superoxidu enzymem FerB a testována hypotéza, že FerB je schopen redukovat membránový ubichinon. U divokého kmene a mutantních kmenů bez FerA resp. FerB nebo s jejich zvýšenou produkcí bude porovnán stupeň peroxidace membránových lipidů. Proteomická analýza buněk vystavených redoxním stresorům pomůže při identifikaci členů redoxního regulonu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The aim was described the crystal structure of the bacterial flavin reductase FerA and in complex with FMN. Structural data, together with results of enzyme kinetic, substrates binding and site-directed mutagenesis studies, unravel molecular mechanisms for interaction of FerA with substrates and the catalyzed process. FerB was found to remove superoxide by converting it into hydrogen peroxide.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Apr 25, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
4,924 thou. CZK
Public financial support
4,924 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK