All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Novel flavin-dependent enzymes of Paracoccus denitrificans: reaction mechanisms, metabolic functions and their role in cellular oxidative stress

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)

  • Main participants

    Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    P503-12-0369

Alternative language

  • Project name in Czech

    Nové flavin-dependentní enzymy Paracoccus denitrificans: reakční mechanismy, metabolické funkce a úloha v buněčném oxidačním stresu

  • Annotation in Czech

    Projekt se zabývá dvěma enzymy, flavin reduktasou FerA a chinonreduktasou FerB, spojenými s generováním nebo zvládáním oxidačního stresu u bakterie Paracoccus denitrificans, často nazývané “volně žijící mitochondrie”. Bude izolován gen pro FerA a připravený odpovídající rekombinantní protein bude charakterizován enzymologicky, krystalograficky a pomocí místně řízené mutageneze. Bude stanoveno, zda FerA působí samostatně nebo v kombinaci s dalšími proteiny. V pokusech in vitro bude kvantifikována produkce superoxidu enzymem FerB a testována hypotéza, že FerB je schopen redukovat membránový ubichinon. U divokého kmene a mutantních kmenů bez FerA resp. FerB nebo s jejich zvýšenou produkcí bude porovnán stupeň peroxidace membránových lipidů. Proteomická analýza buněk vystavených redoxním stresorům pomůže při identifikaci členů redoxního regulonu.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    CE - Biochemistry

  • CEP - secondary branch

    EE - Microbiology, virology

  • CEP - another secondary branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    The aim was described the crystal structure of the bacterial flavin reductase FerA and in complex with FMN. Structural data, together with results of enzyme kinetic, substrates binding and site-directed mutagenesis studies, unravel molecular mechanisms for interaction of FerA with substrates and the catalyzed process. FerB was found to remove superoxide by converting it into hydrogen peroxide.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2012

  • Realization period - end

    Apr 25, 2017

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Mar 26, 2015

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP18-GA0-GA-U/02:1

  • Data delivery date

    May 4, 2018

Finance

  • Total approved costs

    4,924 thou. CZK

  • Public financial support

    4,924 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK