Structure, function and regulation of FerB, a broad-specificity bacterial oxidoreductase of a potential ecotechnological relevance
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
525/07/1069
Alternative language
Project name in Czech
Struktura, funkce a regulace FerB, širokospecifické bakteriální oxidoreduktasy s možným významem pro ekotechnologii
Annotation in Czech
Enzym FerB z Paracoccus denitrificans byl původně objeven naší skupinou jako NAD(P)H závislá oxidoreduktasa schopná redukovat železité komplexy, chinony a chroman. Vzhledem k možnému využití FerB pro bioremediaci šestimocného chromu a snad i jiných těžkých kovů navrhujeme nyní systematický výzkum tohoto enzymu metodami obecné biochemie a strukturní a molekulární biologie. Gen kódující FerB bude amplifikován a klonován na základě známých 27 aminokyselinových zbytků na N-konci proteinu a již zveřejněné sekvence celého genomu P. denitrificans. Očekáváme, že heterologní exprese genu ferB poskytne velká množství čistého rekombinantního proteinu pro studie zaměřené na substrátovou specifitu, stechiometrii přenosu elektronů a redoxní kinetiku vázaného flavinového koenzymu. Budou také zahájeny pokusy o krystalizaci FerB a sběr difrakčních dat pro strukturní analýzu. Sebevražedné vektory a triparentální křížení poslouží k sestrojení mutantních kmenů bez FerB a reportérových kmenů nesoucích
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
DK - Contamination and decontamination of soil including pesticides
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10511 - Environmental sciences (social aspects to be 5.7)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 22, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Jan 22, 2015
Finance
Total approved costs
1,070 thou. CZK
Public financial support
1,070 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK