Characterization of the 3' RNA uridylation in human cells
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-21341S
Alternative language
Project name in Czech
Studium úlohy uridylace RNA v lidských buňkách
Annotation in Czech
RNA v eukaryotických buňkách prochází řadou posttranskripčních úprav, jako jsou chemické modifikace bází či extenze 3' konců. Pouze nedávno bylo odhaleno, že uridylace RNA hraje líčovou roli v regulaci procesování miRNA a v degradaci histonových mRNA. Obecně je uridylace považována za značku pro zkracování a celkovou degradaci RNA. Savčí buňky kódují nejméně čtyři proteiny, které jsou schopné přidávat oligouridylové konce, a dvě exoribonukleázy specificky targetující uridylované RNA. Mutace v několika těchto faktorech jsou spojovány s některými typy rakoviny a vývojovými poruchami. Cílem tohoto projektu je odhalení širšího spektra typů RNA, které podléhají uridylaci a identifikovat faktory zodpovědné za tuto modifikaci. Následně pak budeme studovat úlohu uridylace na procesování, stabilitu a funkci dané RNA. Výsledky našich studií výrazně posunou pochopení úlohy 3' terminální uridylace v metabolismu RNA a regulaci genové exprese.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The aim of this project was to identify RNA molecules that are subject to uridylation and to identify responsible protein factors. The project also studied biological consequences of uridylation and more general mechanisms of RNA degradation. It resulted in several high quality publications (NAR, EMBOJ), one review and a book chapter. The project can therefore be evaluated as very successful.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Jul 22, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 24, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Apr 12, 2021
Finance
Total approved costs
9,565 thou. CZK
Public financial support
9,343 thou. CZK
Other public sources
222 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK