Functional and biochemical characterization of Dis3L2, the third mammalian homolog of the key yeast exosome nuclease Dis3p
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P305-11-1095
Alternative language
Project name in Czech
Funkční a biochemická charakterizace proteinu Dis3L2, třetího lidského homologu hlavní kvasinkové exosomové nukleázy Dis3p
Annotation in Czech
Degradace RNA v eukaryotech hraje klíčovou úlohu v regulaci genové exprese. Jedním z nezbytných faktorů procesování a degradace 3 konců RNA je proteinový komplex zvaný exosom. Ačkoli jeho jádro tvoří šest potenciálních exoribonukleáz, ani jedna z nich sinezachovala enzymatickou aktivitu. Jedinou katalyticky aktivní podjednotkou je protein Rrp44p nebo také Dis3p, jehož funkce a aktivity byly dosud podrobně popsány pouze u kvasinek. Savčí buňky kódují 3 sekvenční homology kvasinkové Rrp44p: DIS3, DIS3L aDIS3L2. Poslední ze zmíněných proteinů se zdá být nejodlišnější, jelikož postrádá doménu, která je v kvasinkové Rrp44p zodpovídá za vazbu na celý zbytek exosomu a její absence je letální. Cílem tohoto projektu je detailní studium funkce DIS3L2 v lidských tkáňových kulturách, charakterizace jeho substrátového repertoáru RNA a biochemická charakterizace enzymatických a vazebných aktivit na RNA. Vzhledem ke klíčové úloze Rrp44p v kvasinkách předpokládáme, že každý ze tří zmíněných homologů bude mít významnou úlohu na buněčné i organismální úrovni u savců.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project was fulfilled in an excellent way and yielded important new knowledge on the role of DIS3L2 as an exonuclease specifically targeting uridylated microRNA, revealing the role of uridinylation in the metabolism of RNA in the cell. The tree published papers (in high quality journals like Genes & Development, Nucleic Acids Research, RNA) received high attention of the research community.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 18, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
May 22, 2015
Finance
Total approved costs
10,240 thou. CZK
Public financial support
10,240 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK