The function of the TRAMP4 complex in the formation of 3'-ends of mRNAs in Saccharomyces cerevisiae
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-20388S
Alternative language
Project name in Czech
Úloha komplexu TRAMP4 při tvorbě 3' konců mRNA v kvasince Saccharomyces cerevisiae
Annotation in Czech
Kvasinková RNA polymeráza II (RNAPII) syntetizuje RNA kódující proteiny i nekódující RNA. Existují dva mechanismy terminace transkripce zprostředkované RNA polymerázou, přičemž oba jsou regulovány fosforylací C-terminální domény (CTD) RNAPII. Při terminaci transkripce nekódujících molekul RNA, fosforylovaný serin v pozici 5 slouží jako signál k interakci CTD-interagující domény (CID) proteinu Nrd1, který je podjednotkou terminačního komplexu Nrd1p-Nab3p-Sen1p (NNS). Transkripty nekódujících RNA jsou poté polyadenylovány komplexem proteinů Trf4p/Air1p/Air2p/Mtr4p (TRAMP4), na což navazuje procesování 3’-konce nebo degradace jaderným exosomem. V případě terminace transkripce mRNA, fosforylovaný serin v pozici 2 v CTD je rozlišen CID doménou proteinu Rtt103p, který tvoří komplex s Rai1 a 5’-3’ exoribonukleázou Rat1p, který je zodpovědný za terminaci transkripce. V předkládaném grantovém projektu plánujeme objasnit molekulární charakter interakce mezi CID doménou Rtt103p a komplexem TRAMP4 a odhalit, zda tato interakce hraje klíčovou roli v kontrole kvality mRNA nebo terminaci transkrip
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
—
Latest support payment
Apr 10, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/11:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
8,435 thou. CZK
Public financial support
8,240 thou. CZK
Other public sources
195 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK