The role of Cdk12 and C-terminal domain of RNA polymerase II in transcription-coupled genome instability
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-09979S
Alternative language
Project name in Czech
Role Cdk12 a C-terminální domény RNA polymerázy II v transkripcně regulovaném procesu genomové nestability
Annotation in Czech
RNA polymeráza II (RNAPII) řídí transkripci protein kódujících genů. Obsahuje C-terminální doménu (CTD) s repeticí heptapeptidu YSPTSPS, kde jsou jednotlivé seriny (Ser) fosforylovány. Fosforylační status CTD reguluje transkripční cyklus a další bunečné procesy. Náš výzkum vedl k objevu role CTD v transkripčně regulovaném procesu genomové nestability. Identifikovali jsme Cyklin K-asociované kinázy Cdk12 and Cdk13 a dále jsme zjistili, že Cdk12 fosforyluje Ser2 v CTD a že reguluje expresi významných “DNA damage response” (DDR) genů, včetně BRCA1, FANCI a ATR. V souladu s tímto zjištením je deregulace proteinu Cdk12 v různých nádorech. Nicméné, mechanismus, který, řídí expresi Cdk12 závislých DDR genů je nejasný; podobně funkce Cdk13 v bunce není známá. Návrh tohoto grantu má za cíl: 1) identifikaci proteinových komplexů Cdk12 a Cdk13, 2) zjistění role Cdk12 regulované transkripční elongace a mRNA procesování na expresi DDR genu a 3) objasnění funkce Ser2 kinázové activity Cdk12 pri expresi DDR genů a při vzniku rakoviny.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Main results of the project include the fundamental mocelular genetic characterization of Cdk12/Cdk13 interactome, identification of target genes for Cdk12/Cdk13 and characterization of ovarian cancer related kinase activity of Cdk12. The results were published in 5 papers in eminent scientific journals. Financial resources were used in conformity with the grant agency rules.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
7,155 thou. CZK
Public financial support
7,155 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK