The novel isoform of cyclin K is a partner of cdk12 kinase regulating eukaryotic transcription and alternative splicing
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P305-11-1564
Alternative language
Project name in Czech
Nová izoforma cyklinu K je partnerem kinázy cdk12 regulující transkripci a alternativní sestřih u eukaryot
Annotation in Czech
Transkripce protein kodujících genů je řízena za pomocí RNA polymerázy II (RNAPII). Fosforylační status C-terminální domény (CTD), která je součástí velké podjednotky RNAPII, přímo koresponduje s právě probíhajícími fázemi transkripčního cyklu a post-transkripční procesů, včetně kontroly pre-mRNA. Tento takzvaný "CTD kód" je zcela pod kontrolou několika cyklin-dependetních kináz (cdk). Mezi nimi, cdk9 společně s jejím navázaným cyklinem T1, T2 nebo K (CycK), je přímo zodpovědná za řízení elongační fáze transkripce. Původně byl popsán CycK jako 40 kDa protein se silnou CTD kinázovou aktivitou. Za využití imunoprecipitace a následné hmotnostní spektrometrie se nám podařilo objevit zcela novou, 70 kDa formu cycK, která se specificky váže s cdk12. Předpokládáme, že tento nový cycK/cdk12 komplex je CTD kinázou a reguluje transkripci a alternativní sestřih. V návrhu projektu plánujeme a) biochemicky charakterizovat tento nový komplex, b) objasnit jeho CTD kinázovou aktivitu a c)vyjasnit jeho úlohupři regulaci globální eukaryotické transkripce a alternativního sestřihu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project brings important new knowledge on the function of metazoan Cdk/cyclin complexes (with possible medical relevance). The outputs (one first-author research paper and two reviews) were published in prestigious high-impact journals are already highly cited. Final report and accounting are without problems or irregularities.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 12, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
5,282 thou. CZK
Public financial support
5,089 thou. CZK
Other public sources
193 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK