Regulation of gene expression by a new mRNA-binding factor
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-10930S
Alternative language
Project name in Czech
Regulace genové exprese novým faktorem vázajícím mRNA
Annotation in Czech
Nedávný výzkum ukázal, že existuje mnohem vice mRNA vázajících proteinů, než se dosud předpokládalo, zejména mezi proteiny, které nemají kanonickou RNA vázající doménu. Transkripční cyklin dependentní kinázy (tCDK ) hrají zásadní roli při regulaci genové exprese a vzniku mnoha chorob. Nicméně, v případě některých tCDK není zcela jasný molekulární mechanismus jejich funkce. Naše výsledky ukazují, že jedna z tCDK přímo váže, skrze svou konzervovanou sekvenci, mRNA, což jí charakterizuje jako první mRNA vázající CDK. Předpokládáme, že pro tuto CDK je vazba na mRNA zcela zásadni pro vykonávání její funkci při regulaci genové exprese. Našim cílem je charakterizace vazby mezi CDK a mRNA, identifikace konkrétních mRNA a proteinů, ktere vážou tuto CDK a provedení funkčních experimentů, které výsvětlí roli této CDK při regulaci genové exprese. Našim hlavním cílem bude zejména vysvětlení úlohy jakou nascentní a maturovaná mRNA stejně jako RNA polymeráza II a transkripční a kotranskripční faktory hrají při regulaci funkce této CDK a na ní závislé exprese genů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
In accord with the aims, CDK11 function in RDH histone gene regulation at the level of nascent mRNA binding has been demonstrated. The findings appear in a single manuscript, which has been accepted for publication in Nature Structural & Molecular Biology (IF=12.1). The manuscript acquired a DOI: 10.1038/s41594-020-0406-8.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Jul 22, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 24, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Apr 12, 2021
Finance
Total approved costs
9,396 thou. CZK
Public financial support
9,396 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK