The role of the non-coding RNome in the physiology and virulence of the human pathogen Bordetella pertussis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-12338S
Alternative language
Project name in Czech
Role nekódujícího RNomu ve fyziologii a virulenci lidského patogena Bordetella pertussis
Annotation in Czech
Bordetella pertussis je gramnegativní lidský patogen a původce černého kašle, vysoce nakažlivé respirační choroby. Výskyt tohoto onemocnění je v současné době na vzestupu a to i ve vyspělých zemích s vysokou mírou vakcinace jako je Česká republika. Patogenní baktérie se musí během infekce rychle adaptovat na hostitelské prostředí a čelí tak různým stresovým podmínkám. Zejména u gramnegativních baktérií představuje post-transkripční kontrola genové exprese pomocí RNA chaperonu Hfq a malých nekódujících RNA účinný mechanizmus jak se na nové prostředí adaptovat. Naše výsledky ukázaly, že Hfq protein hraje důležitou roli ve virulenci B. pertussis a tudíž naznačily, že post-transkripční regulace zprostředkovaná nekódujícími RNA se může významně podílet na modulaci genové exprese. Analýza primárního transkriptomu B. pertussis odhalila značné množství nekódujících RNA včetně malých sRNA, antisense RNA a riboswitch struktur. Naším cílem je zjistit jaké geny regulují, jaká je jejich biologická role a jak přispívají k patogenezi černého kašle.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Panel evaluated this project as excellent. Its results were high quality publication and, more importantly, better understanding of B. pertussis. Especially the analysis of the role of magnesium (including a molecular mechanism) in the pathogenesis of B. pertussis deserves special attention. Also all the formal requirements were fulfilled.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 30, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
8,758 thou. CZK
Public financial support
8,758 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK