The importance of having YS phosphorylated. Investigation of interaction between CTD and transcription elongation factor Spt6
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-24117S
Alternative language
Project name in Czech
Zásadní význam fosforylace YS. Studium interakce mezi CTD a transkripčním elongačním faktorem Spt6
Annotation in Czech
Histonový chaperon Spt6 je vysoce konzervovaný protein, který se účastní procesů transkripční elongace, spravování chromatinu a zpracování mRNA. Spt6 je potřebná k vazbě RNA procesních faktorů na RNA polymerázu II (RNAPII) ve fázi transkripční elongace. Flexibilní C-terminální doména RNAPII (CTD) je rozpoznávána tandemovou SH2 doménou proteinu Spt6. Změny ve fosforylaci na CTD s kozervovanou repeticí heptapetidu Y1S2P3T4S5P6S7 kontrolují během transkripčního cyklu vazbu transkripčních a mRNA procesních faktorů na RNAPII. Nedávno bylo ukázáno, že fosforylace na pozici Y1 podporuje vazbu elongačního faktoru Spt6. V předkládaném projektu navrhujeme použití nukleární magnetické rezonance (NMR), dynamické analýzy transkriptomu (DTA) a fluorescenční anizotropie (FA) k pochopení klíčových molekulárních a strukturních vlastností, které ovlivňují interakci mezi Spt6 a specificky fosforylovanou CTD in vivo a in vitro.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project successfully solved interaction between elongation factor Spt6 and CTD from RNAPolII. It brings new insights into the CDT-transcription factor interaction. However, owing to the competing publication, the project was delayed and the key paper is not yet published.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Apr 25, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 2, 2020
Finance
Total approved costs
9,153 thou. CZK
Public financial support
9,153 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK