Strong epistatic control of development of leishmaniasis – identification of genes and mechanisms
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-22346S
Alternative language
Project name in Czech
Silná epistatická kontrola vývoje leishmaniázy - identifikace genů a mechanismů
Annotation in Czech
Epistáze, neaditivní interakce dvou nebo více genů, je zodpovědná za velkou část genetického vlivu na vývoj chorob, ale je ji obtížné studovat kvůli účasti velkého množství genů. Proto jsme vytvořili myší model charakterizovaný silným epistatickým vlivem na vnímavost k leishmaniáze. Kmen B10.O20 nese 4% genů rezistentního kmene O20 a 96% genů rezistentního kmene C57BL/10, ale je vysoce vnímavý. Určíme genetickou podstatu této epistáze tak, že zmapujeme geny původu O20, které u kmene B10.O20 ovlivňují průběh a symptomy onemocnění a imunitní odpověď k infekci. Funkční účinky těchto genů analyzujeme tak, že u kmenů O20, C57BL/10 a B10.O20 srovnáme globální genové exprese a ontologické dráhy aktivované v neinfikovaných a infikovaných myších a určíme rozdíly mezi neinfikovanými myšmi těchto kmenů a rozdíly objevujícimi se po infekci, a určíme změny v hladině exprese asociované s infekcí. To objasní charakter odolnosti a vnímavosti k leishmaniáze kontrolované epistatickými interakcemi.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EC - Immunology
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30102 - Immunology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The main aims of the project were fulfilled. The project brought new knowledge in the area of leishmaniasis, especially in clarifying the nature of the resistance and susceptibility to leishmaniasis controlled by epistatic interactions on mouse model. The results were presented in 5 papers and 1 review in high quality journals, 1 patent, 3 manuscripts are in preparation.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Jul 22, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Apr 12, 2021
Finance
Total approved costs
5,821 thou. CZK
Public financial support
5,773 thou. CZK
Other public sources
48 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK