All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Structural basis for the emergence of new enzymatic activities

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

  • Main participants

    Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    16-24223S

Alternative language

  • Project name in Czech

    Strukturní podstata vzniku nových enzymových aktivit

  • Annotation in Czech

    Pochopení vzniku nové enzymatické funkce na molekulární úrovni patří ke klíčovým otázkám biologie. Hlavním cílem projektu je získat porozumění strukturní podstaty katalytických vlastností rekonstruovaného předka dvou funkčně odlišných enzymů, eukaryotní halogenalkandehalogenasy ze Strongylocentrotus purpuratus a luciferasy z Renilla reniformis, vykazujícího duální hydrolasovou a oxidoreduktasovou aktivitu. V projektu chceme dále pochopit, proč oba současné enzymy mají odlišné katalytické funkce, přestože sdílejí vysokou sekvenční a strukturní podobnost. Tohoto cíle bude dosaženo kombinací rentgenové strukturní analýzy ancestrálního enzymu a jeho komplexů s vybranými ligandy s molekulovým modelováním, místně cílenou mutagenezí a kinetickou analýzou ve stacionárním a tranzitním stavu. Prostřednictvím analýzy strukturně-funkčních vztahů enzymu bude možné vysvětlit katalytický mechanismus rekonstruovaného předka a objasnit odlišnou funkci moderních enzymů. Získané znalosti přispějí k designování enzymů s novými katalytickými aktivitami.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    CE - Biochemistry

  • CEP - secondary branch

    BO - Biophysics

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    A functional and structural characterization of luciferase AncHLD-RLuc and its comparison with related enzymes LinB and RLuc8 were performed. The crystal structure of AncHLD-RLuc was solved, its catalytic mechanism was elucidated and regions whose modification enable substantial enhancement of the catalytic efficiency were identified. Three papers were published, one is currently under review.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2016

  • Realization period - end

    Dec 31, 2018

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    May 25, 2018

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP19-GA0-GA-U/01:1

  • Data delivery date

    Jun 12, 2019

Finance

  • Total approved costs

    6,800 thou. CZK

  • Public financial support

    6,672 thou. CZK

  • Other public sources

    128 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK