All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Mass Spectrometric 3D Structure Analysis of DNA Response Elements / Transcription Factor Association and Modeling

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

  • Main participants

    Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    16-24309S

Alternative language

  • Project name in Czech

    Strukturní analýza interakce transkripčních faktorů s promotorovými sekvencemi

  • Annotation in Czech

    Strukturní analýzu in vivo interakcí heterogeních biomolekulárních komplexů brzdí nedostatek vhodných a vysoce výkonných metod s dostatečnou rozlišovací schopností. Na hmotnostní spektrometrii (MS) založená 2D proteomická analýza interaktomu v současnosti představuje zlatý standard pro cílenou identifikaci nových léčiv. Metody strukturní biologie využívající hmotnostní spektrometrii (MS3D) s podporou molekulárně dynamického modelováním (MD) jsou plně komplementární se stávajícími strukturními metodami s vysokým rozlišením, pracujících za nenativních podmínek. Cílem projektu je vývoj MS3D metody vhodné ke studiu interakčního páru transkripční faktor-promotorová sekvence na modelech in vitro a in vivo. Informace o struktuře a interakčních partnerech biolmolekul, které budou získány technikami s nízkým prostorovým rozlišením, budou sloužit jako vstupní údaj pro tvorbu modelů komplexů pomocí MD. Výstupem projektu budou nové MS3D metody, které budou fungovat za nativních podmínek a budou tvořit nový standard pro analýzu biomolekulárních komplexů s potenciálem sofistikované přípravy léčiv.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    CE - Biochemistry

  • CEP - secondary branch

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

  • Project results evaluation

    This project deals with the development and implementation of advanced proteomic methodologies using the cutting edge mass spectrometric instrumentation. The project involves the cooperation with leading US group including the student exchanges and the development of new type of ion source. Results were published in 7 papers, mostly in high-impact journals.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2016

  • Realization period - end

    Jul 22, 2020

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Apr 26, 2018

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP21-GA0-GA-U/01:1

  • Data delivery date

    Apr 12, 2021

Finance

  • Total approved costs

    4,554 thou. CZK

  • Public financial support

    4,554 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK