Structural basis for the specificity of signal transduction in plants: interaction network of histidine kinase receiver domains in Arabidopsis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P305-11-0756
Alternative language
Project name in Czech
Strukturní princip specificity přenosu signálu v rostlinách: síť interakcí příjímačové domény histidinkinas u Arabidospis
Annotation in Czech
Specificitě přenosu signálu rozumíme u rostlin mnohem méně než u živočichů. Navrhujeme studovat molekulární podstatu specificity cytokininové signální dráhy, řídící tvorbu rostlinné biomasy, na vhodném rostlinném modelu Arabidopsis thaliana. Projekt je zaměřen na interakce mezi cytokininovým receptorem a skupinou proteinů následujících ve fosforylační kaskádě. Specificita interakcí a její modulace bude zkoumána kombinací metod strukturní, molekulární a buněčné biologie. Nukleární magnetická resonance a rentgenová krystalografie poskytnou strukturní popis s atomovým rozlišením, metody charakterizace vazby in-vitro popíší kvantitativně vazebné afinity a metody in-vivo poskytnou popis interakční sítě v živých buňkách. Řízená mutageneze bude použita k ověření interakčního modelu zaváděním změn ve specificitě. Výsledky budou využity v následujícím studiu řepky (Brassica napus), příbuzného ale složitějšího organismu velkého ekonomického významu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
ED - Physiology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project contributed to the understanding of mechanisms of cytokinin signalling in plants, and brought also significant methodological advances to the study of protein structure-function relationships. Results have been published in respected journals (5 papers published, 1 accepted, additional r manuscript under review).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Apr 7, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
7,564 thou. CZK
Public financial support
7,564 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK