Alternative splicing as a regulator of auxin transport
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-26428S
Alternative language
Project name in Czech
Alternativní sestřih jako regulátor auxinového transportu
Annotation in Czech
Alternativní sestřih zajišťuje dodatečný regulační krok v kontrole genové exprese. V modelové rostlině Arabidopsis thaliana je známo jen nemnoho důkazů poukazujících na důležitost alternativního sestřihu v kontextu rostlinné morfogeneze a regulace hormonálních drah. Na příkladu rodiny důležitých hormonálních regulátorů demonstrujeme funkci alternativního sestřihu jako integrátora kořenové morfogeneze a hormonální odpovědi. Naše počáteční data ukazují, že alternativní sestřih mění vnitobuněčnou lokalizaci těchto hormonálních regulátorů. V našich nepublikovaných transkriptomických datech z kořenových špiček jsme nalezli rovněž několik dosud neanotovaných transkriptů a schraňujeme důkazy, že tyto transkripty by mohly mít relevantní biologickou funkci. Rovněž navrhujeme inovativní systém pro vizualizaci studovaných isoforem přímo v místě, kde jsou exprimovány. A následně předkládáme rychlý a efektivní systém pro genetický screen, jehož úkolem je odhalit molekulární faktory, které kontrolují alternativní sestřih hormonálních regulátorů, které studujeme.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The solution provided knowledge about the role of alternative splicing of auxin transporters from the PIN protein family in auxin transport and plant development. The exclusive involvement of doctoral students, master's and bachelor's students in the project solution is also positive. The output is 3 publications in periodicals with a rather average IF, one manuscript stored on Biorxiv.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 11, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Apr 12, 2021
Finance
Total approved costs
5,711 thou. CZK
Public financial support
5,711 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK