Molecular nature of evolutionary telomere transitions in Asparagales plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.<br>Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-09644S
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární podstata evolučních přeměn telomer u rostlin řádu Asparagales
Annotation in Czech
V r. 2016 jsme identifikovali neobvyklé telomery u rostlin rodu Allium. Společně s našimi předchozími výsledky je nyní jasné, že během evoluce rostlin řádu Asparagales došlo ke dvěma změnám telomer: při první, spojené s divergencí rodu Iris, byly typické rostlinné telomery (TTTAGGG)n nahrazeny telomerami (TTAGGG)n typickými pro obratlovce. Ke druhé změně - z (TTAGGG)n na (CTCGGTTATGGG)n - došlo při divergenci rodu Allium. Cílem projektu je objasnit molekulární podstatu těchto tranzicí - změny v RNA podjednotkách telomeráz a v jejich interakcích s katalytickými podjednotkami - a dále zjistit dopad těchto změn na nukleoproteinové složení a na funkci telomer, která závisí hlavně na telomer-vazebných proteinech. RNA-Seq data budou získána z obohacených frakcí telomerázy a z celkového transkriptomu s cílem identifikovat RNA podjednotky telomeráz, resp. kandidátní telomer-vazebné proteiny. Interakce proteinů se současnými a ancestrálními telomerovými DNA budou testovány kvantitativními přístupy. Projekt zlepší chápání strukturně-funkčních vztahů telomer a role telomer ve speciaci.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project was focused on elucidation of molecular mechanisms of evolutionary transitions of telomeres by characterisation of telomerase RNA subunits in a wide range of land plants. Telomerase RNAs exhibit substantial variability resulting from diverse telomere DNAs, while a subset of orthologous plant telomere-binding proteins is conserved. The implications for telomerase functions were evaluated.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 26, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
Jul 23, 2020
Finance
Total approved costs
10,203 thou. CZK
Public financial support
9,000 thou. CZK
Other public sources
1,203 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK