Molecular analysis of the structure and function of typical and alternative telomeres in plants
Project goals
Telomeres, nucleoprotein complexes forming the ends of eukaryotic chromosomes, are indispensable structure-functional genome domains. The proposed project is based on outcomes of the previous project GACR 521/96/1123 in which the plant telomerase, synthesising "typical" telomeres of [TTTAGGG]n sequence has been described and investigated. The aim of the proposed project is to increase a knowledge of structure of the "typical" telomeres, namely in the field of telomere-binding proteins, specific featuresof chromatin structure and telomere-end-conformation (presence of t-loops). Besides, the project is focused on the study of so called alternative telomeres in a wide group of Asparagales plants (including cca 6000 species). In selected members of this group, DNA forming chromosome ends instead of repeats synthesised by telomerase will be analysed. Telomerase activity will be tested in these plants, and in case of its expected absence, it will be determined whether it results from the presence
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární analýza struktury a funkce typických a alternativních telomer u rostlin
Annotation in Czech
Telomery, nukleoproteinové komplexy tvořící konce eukaryotických chromosomů, jsou nepostradatelné strukturně-funkční domény genomu. Navrhovaný projekt navazuje na projekt GAČR 521/96/1123, v jehož rámci byla objevena a zkoumána rostlinná telomeráza a jísyntetizované "typické" telomery o sekvenci [TTTAGGG]n. Navrhovaný projekt si klade za cíl jednak prohloubit znalosti struktury těchto "typických" telomer, především v oblastech telomer-vazebných proteinů, specifických rysů chromatinové struktury a konformace konců telomer (přítomnost t-smyček). Vedle toho je projekt zaměřen na studium tzv. alternativních telomer u rozsáhlé skupiny rostlin Asparagales (zahrnující cca 6000 druhů). U vybraných zástupců této skupiny budou analyzovány sekvence DNA tvořící konce chromozómů namísto obvyklých repetic syntetizovaných telomerázou. Bude testována aktivita telomerázy u těchto rostlin, a v případě její očekávané absence bude zjištěno, zda je důsledkem přítomnosti inhibitorů telomerázy či ztráty funkce
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
EF - Botany
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10610 - Biophysics
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
1. Finding of alternative telomeres in plants: result of a study of apparent loss of telomeres in a group of monocotyledonous plants of Asparagales order and dicotyledonous plant genera Cestrum, Vestia and Sessea (Solanaceae). In molecular evolution of A
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Data delivery date
Jun 2, 2008
Finance
Total approved costs
4,982 thou. CZK
Public financial support
2,843 thou. CZK
Other public sources
2,139 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
4 982 CZK thou.
Public support
2 843 CZK thou.
57%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2002 - 01. 01. 2004