All
All

What are you looking for?

All
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Molecular analysis of the structure and function of typical and alternative telomeres in plants

Project goals

Telomeres, nucleoprotein complexes forming the ends of eukaryotic chromosomes, are indispensable structure-functional genome domains. The proposed project is based on outcomes of the previous project GACR 521/96/1123 in which the plant telomerase, synthesising "typical" telomeres of [TTTAGGG]n sequence has been described and investigated. The aim of the proposed project is to increase a knowledge of structure of the "typical" telomeres, namely in the field of telomere-binding proteins, specific featuresof chromatin structure and telomere-end-conformation (presence of t-loops). Besides, the project is focused on the study of so called alternative telomeres in a wide group of Asparagales plants (including cca 6000 species). In selected members of this group, DNA forming chromosome ends instead of repeats synthesised by telomerase will be analysed. Telomerase activity will be tested in these plants, and in case of its expected absence, it will be determined whether it results from the presence

Keywords

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

  • Main participants

    Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

Alternative language

  • Project name in Czech

    Molekulární analýza struktury a funkce typických a alternativních telomer u rostlin

  • Annotation in Czech

    Telomery, nukleoproteinové komplexy tvořící konce eukaryotických chromosomů, jsou nepostradatelné strukturně-funkční domény genomu. Navrhovaný projekt navazuje na projekt GAČR 521/96/1123, v jehož rámci byla objevena a zkoumána rostlinná telomeráza a jísyntetizované "typické" telomery o sekvenci [TTTAGGG]n. Navrhovaný projekt si klade za cíl jednak prohloubit znalosti struktury těchto "typických" telomer, především v oblastech telomer-vazebných proteinů, specifických rysů chromatinové struktury a konformace konců telomer (přítomnost t-smyček). Vedle toho je projekt zaměřen na studium tzv. alternativních telomer u rozsáhlé skupiny rostlin Asparagales (zahrnující cca 6000 druhů). U vybraných zástupců této skupiny budou analyzovány sekvence DNA tvořící konce chromozómů namísto obvyklých repetic syntetizovaných telomerázou. Bude testována aktivita telomerázy u těchto rostlin, a v případě její očekávané absence bude zjištěno, zda je důsledkem přítomnosti inhibitorů telomerázy či ztráty funkce

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - secondary branch

    BO - Biophysics

  • CEP - another secondary branch

    EF - Botany

  • 10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
    10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
    10605 - Developmental biology
    10608 - Biochemistry and molecular biology
    10609 - Biochemical research methods
    10610 - Biophysics
    10611 - Plant sciences, botany
    10612 - Mycology
    30101 - Human genetics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

  • Project results evaluation

    1. Finding of alternative telomeres in plants: result of a study of apparent loss of telomeres in a group of monocotyledonous plants of Asparagales order and dicotyledonous plant genera Cestrum, Vestia and Sessea (Solanaceae). In molecular evolution of A

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2002

  • Realization period - end

    Jan 1, 2004

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7

  • Data delivery date

    Jun 2, 2008

Finance

  • Total approved costs

    4,982 thou. CZK

  • Public financial support

    2,843 thou. CZK

  • Other public sources

    2,139 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK

Basic information

Recognised costs

4 982 CZK thou.

Public support

2 843 CZK thou.

57%


Provider

Czech Science Foundation

CEP

EB - Genetics and molecular biology

Solution period

01. 01. 2002 - 01. 01. 2004