Alternative telomeres with uknown sequence in plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 14 (SGA0201300006)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-10948P
Alternative language
Project name in Czech
Alternativní telomery s neznámou sekvencí u rostlin
Annotation in Czech
Telomery jsou nukleoproteinové konce eukaryotických chromozómů, které i) kompenzují ztrátu DNA v důsledku neúplné replikace, ii) odlišují chromozomové konce od dsDNA zlomů, iii) brání neadekvátní rekombinaci a koncovým chromozomálním fúzím. Tyto funkce jsou podmíněny přítomností telomerových proteinů interagujících v komplexu nazvaném shelterin. Hlavní roli při obnovování délky telomer sehrává reverzní transkriptáza ? telomeráza. Díky její aktivitě jsou telomery tvořeny minisatelity s repetitivní jednotkou typu 5´-(TxAyGz)n-3´. Avšak stále častěji jsou nalézány výjimky se změněnou či neznámou terminální sekvencí DNA, u kterých alternativní způsob udržování telomer (ALT) telomerázu nahradil (např. dvoukřídlý hmyz, kvasinky, některé typy zhoubných nádorůa rostliny). Dvouděložné rostliny z čeledi Solanaceae (Vestia, Sessea a Cestrum) a jednoděložné rostliny z čeledi Alliaceae (např. A. cepa a A. sativum) jsou skvělou příležitostí pro studium způsobu, jakým se eukaryotická buňka a její genom vyrovná se ztrátou telomerázového systému bez ztráty integrity a evoluční perspektivy.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
New unknown telomeric sequence (TTTTTTAGGG)n was identified in Cestrum elegans plant; additional unusual telomeric sequence (CTCGGTTATGGG)n was identified in Alliaceae plants. The real telomeric role was confirmed using in vitro methods. Two papers havebeen accepted in Plant Journal.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-GA0-GP-U/01:1
Data delivery date
May 6, 2016
Finance
Total approved costs
2,756 thou. CZK
Public financial support
2,756 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK