Polymorphic G-quadruplexes in gene promoters
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.<br>Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-12075S
Alternative language
Project name in Czech
Polymorfní G-quadruplexy v promotorových oblastech genů
Annotation in Czech
G-kvadruplexy (G4) jsou čtyř-řetězcové DNA struktury. Sekvence, které mají schopnost formovat G4 se hojně vyskytují v lidském genomu. G4 se ve zvýšené míře vyskytují v promotorových oblastech genů. G4 podílející se na regulaci transkripce jsou jednou z nejvíce studovaných skupin strukturních motivů DNA. Stabilizace G4 motivů pomocí nízkomolekulárních látek, jež vede k modulaci exprese onkogenů, se jeví jako velmi slibný přístup léčby rakoviny. G4 motivy jsou strukturně polymorfní; G4 povětšinou existují jako směs různých a různě populovaných konformačních stavů. Populace jednotvých stavů jsou určeny jejich termodynamickou stabilitou a zaroveň i rychlostí jejich formování. Nicméně, ne všechny vlastnosti vykazované polymorfními G4, včetně polymorfismu jako takvého, jsou nutně důležité pro jejich biologickou funkci. Schopnost identifikovat funkčně důležité vlastnosti polymorfních G4 motivů je předpokladem pro racionální vývoj léčiv vykazujících specificitu vůči konkrétním G4 motivům v konkretních oblastech genomu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project dealt with the characterization of structural parameters of G-quadruplex DNA, their biological function and identification of binding proteins. The project resulted in total of five high-quality publications and two book chapters and brought completely new information on these widely present genomic motifs.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 7, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
Jul 23, 2020
Finance
Total approved costs
10,826 thou. CZK
Public financial support
9,812 thou. CZK
Other public sources
1,014 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK