Repeatome dynamics in the earliest evolutionary stages of apomictic plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.<br>Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-14620S
Alternative language
Project name in Czech
Dynamika repetitivních sekvencí v raných stadiích evoluce apomiktických rostlin
Annotation in Czech
Apomixie (nepohlavní tvorba semen) úzce souvisí s hybridizací a polyploidizací. I přes značný potenciál v zemědělství jsou ale její genetické mechanismy zatím velmi málo známé. Hybridizace způsobuje genetickou nestabilitu, zahrnující restrukturalizaci repetitivní DNA, nejrychleji se vyvíjející části rostlinného genomu. Expanze transpozonů způsobená post-hybridizačním genomickým šokem může pak spouštět apomixii. Rozsáhlé experimentální křížení sexuálních a apomiktických rostlin rodu Hieracium a srovnání získaných hybridů s přírodními apomikty stejné rodičovské kombinace a morfologie bude sloužit jako model hybridní speciace, která může vést ke vzniku apomiktických linií. Reprodukční mechanismy budou zjišťovány pomocí průtokové cytometrie, emaskulačních pokusů a cytoembryologických metod. Repetitivní DNA bude analyzována pomocí NGS a repetitivní úseky specifické pro rodičovské taxony budou sloužit jako cytogenetické markery pro analýzu post-hybridizační restrukturalizace genomu. Projekt přispěje k poznání mechanismů podmiňujících přechod od sexuálního k apomiktickému rozmnožování.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project analyzed repeatomes in sexual diploids and apomictic alloplyploids of the genus Hieracium, as well as newly arisen triploids. The differences among tandem repeats in the species under study were larger than among transposable elements.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 26, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
Jul 23, 2020
Finance
Total approved costs
10,045 thou. CZK
Public financial support
9,640 thou. CZK
Other public sources
405 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK