Identification and comparison of plasma/stool miRNA signatures in colorectal cancer by next generation sequencing
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Fakultní nemocnice Plzeň<br>Fakultní Thomayerova nemocnice<br>Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-16857S
Alternative language
Project name in Czech
Identifikace a porovnání miRNA signatur v plazmě a ve stolici pacientů s nádory tlustého střeva a konečníku metodou skevenování nové generace
Annotation in Czech
Deregulované exprese of microRNA (miRNA) byly objeveny u celé řady nádorových onemocnění včetně nádorů tlustého střeva a konečníku (CRC) a naznačují, že tyto molekuly mohou být velmi užitečné v diagnostice onemocnění. MiRNA mohou být rovněž izolovány v plasmě a stolici pacientů, avšak porovnání jejich profilů v okolních tkáních nebylo dosud provedeno. V našem projektu zamýšlíme charakterizovat profily miRNA expresí v plasmě a stolici pacientů s nově diagnostikovaným CRC, u jedinců s prekancerózními lézemi a zdavých jedinců metodou sekvenace nové generace a systémovou biologií. Současné analýzy v plasmě a ve stolici by měly odhalit potenciální mRNA signatury, schopné stanovit průměrné individuální riziko CRC. Prokázané relevantní miRNA v plasmě/stolici budou dále validovány u další skupiny jedinců s obdobnými klinickými charakteristikami a analyzovány ve vztahu k dietě a faktorům životního stylu. Předpokládáme, že miRNA markery v plasmě a ve stolici mohou sloužit jako robustní a dostatečně citlivý nástroj časné detekce CRC a přispět ke optimalizaci skríningových strategií.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Project was successfully realized in agreement with the original project proposal. Project aims were successfully addressed. Authors described microRNA profiles in the stool and body fluids. These microRNA profiles were correlated to selected histo-pathological features of colorectal cancer. This project enabled 12 publications in journals with impact factor (e.g. Nature Medicine či mSystems).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jul 12, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
Jul 23, 2020
Finance
Total approved costs
7,762 thou. CZK
Public financial support
7,657 thou. CZK
Other public sources
105 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK