Concept of liquid biopsy in mapping of microRNA and oncogenic KRAS mutations for early diagnosis and risk assessment of pancreatic cancer.
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202100001
Main participants
Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NU21-07-00247
Alternative language
Project name in Czech
Využití konceptu tekuté biopsie pro charakterizaci mikroRNA a onkogenní KRAS mutace pro stanovení včasné diagnózy a zhodnocení rizika vzniku karcinomu pankreatu.
Annotation in Czech
Nádor pankreatu (PANC) se řadí na druhé místo v příčinách úmrtí na rakovinu v České Republice. Vývoj velmi přesných a neinvazivních biomarkeru časného ohrožení nádorem a stanovení indikátorů maligní transformace u chronických onemocnění pankreatu je velmi žádoucí. Genové exprese deregulovaných miRNA (miR) jsou popsané u solidních nádorů, jsou stabilní a sledovatelné pomocí technik tekuté biopsie v plazmě, i ve stolici. NGS profil širokého spektra miR může poskytnout důležité informace o dynamice vývoje nemoci pankreatu. Po vyhodnocení mutačního spektra mohou být digitálním „droplet“ PCR stanoveny specifické mutace. Relevantní (kandidátní) miR v plazmě/stolici budou validovány v nezávislých skupinách pacientů s uvedenými diagnózám. Analýza KRAS mutací v cirkulující nádorové DNA v plazmě a moči by mohla přispět k designu efektivního, neinvazivního a citlivého markeru časné diagnostiky nádoru pankreatu.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30204 - Oncology
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology<br>FD - Oncology and haematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project had three main objectives. The first was to identify and compare panels of miRNAs in plasma and stool as potential early markers of PDAC. The second aimed to study oncogenic KRAS mutations in blood and transrenal urinary DNA. The third focused on analyzing the relationships between miRNAs, KRAS mutations, and PDAC risk factors. During the project, methodologies were successfully established, and samples from PDAC patients, chronic pancreatitis patients, and healthy controls were analyzed. The final report includes results of KRAS mutation detection and miRNA profiling. Data analysis and interpretation are still ongoing; notably, KRAS analysis has yielded promising results that require validation. No original research articles directly based on the project’s objectives have been published yet. However, the project was acknowledged in several high-quality papers from international consortia, which are more distantly related to the project’s focus.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2021
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 12, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MZ0-NU-U
Data delivery date
Jul 1, 2025
Finance
Total approved costs
13,038 thou. CZK
Public financial support
13,038 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK