From conformation to biological functions of HP1 protein
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-07384S
Alternative language
Project name in Czech
Od konformace po biologické funkce proteinu HP1
Annotation in Czech
Během diferenciace buněk a opravných procesů v DNA lze očekávat změny v post-translačních modifikacích a konformačních vlastnostech heterochromatinového proteinu 1 (HP1). Tyto změny podmíněné epigenetickými událostmi, budou analyzovány teoretickými přístupy výpočetní chemie a pomocí hmotnostní spektrometrie (HS). Z druhé strany budou experimentálně studovány fluorescenční vlastnosti HP1 v čase použitím FLIM-FRET mikroskopie a biologické funkce HP1 proteinů při odlišných FLIM charakteristikách. Budou zkoumány tři typy HP1 proteinů (HP1α, HP1β, HP1γ), včetně možných homodimerů nebo heterodimerů mezi HP1 variantami. Cílem bude ukázat funkce HP1 proteinů z pohledu genové aktivity nebo umlčování genů v průběhu diferenciace nebo opravy DNA. Epigenetické vlastnosti jednotlivých domén HP1 proteinů odvozené z teoretických výpočtů, jejich modifikace detekované pomocí HS a změny konformačního uspořádání, budou korelovány s biologickými funkcemi, jež doprovázejí změny v genové aktivitě.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10601 - Cell biology
OECD FORD - secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - another secondary branch
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
AF - Documentation, librarianship, work with information<br>BC - Theory and management systems<br>BD - Information theory<br>CE - Biochemistry<br>EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology<br>IN - Informatics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2020
Project status
—
Latest support payment
Apr 24, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/18:1
Data delivery date
Feb 27, 2021
Finance
Total approved costs
10,461 thou. CZK
Public financial support
8,850 thou. CZK
Other public sources
1,611 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK