The role of epigenetic processes in DNA repair
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-07822S
Alternative language
Project name in Czech
Úloha epigenetických procesů při reparaci DNA
Annotation in Czech
Každým dnem je genom vystavován genotoxickému stresu, který způsobuje poškození DNA. Poškození DNA iniciuje DNA reparační procesy, které vedou k obnově intaktního řetězce DNA. Z tohoto důvodu jsme se rozhodli studovat odpovědi genomu na poškození DNA u různých buněčných typů, včetně fibroblastů s vyblokovanou funkcí SUV39h histonových metyltransferáz a histonu H2AX. Vybrané buněčné typy budou vystaveny působení různých experimentálních stimulů, které indukují změny v histonovém kódu. Zaměříme se na působení inhibitorů histonových acetyltransferáz (HATs) a histonových deacetyláz (HDACs) na procesy reparace DNA. Dále jsme se rozhodli studovat funkci epigeneticky významných proteinů, jako je HP1 (HP1 beta, ΔCD HP1beta, and ΔCSD HP1beta) a BMI1, v oblastech s indukovanými DNA lézemi. Interakce mezi vybranými proteiny budou testovány metodou FRET. Snaha bude rovněž koncentrována na analýzu profilu γH2AX a 53BP1 ve spontánně se vyskytujících DNA lézích a v kompartmentu jadérek. Výsledky experimentů by měly naznačit, jaké epigenetické procesy probíhají během reparace DNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Results of the project, focused on the study of epigenetic processes with emphasis on post-translational histone modifications, such as acetylation and methylation of histone H3, showed new mechanisms, which take part during DNA repair. The results have been published in 18 publications. Project does not show any deficiency in adherence to grant rules or use of financial resources.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
9,516 thou. CZK
Public financial support
9,516 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK