Postranslational modifications of histones after cell treatment by inhibitors of histone deacetylases and during induction of cell differentiation
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 9 (SGA02006GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/06/0978
Alternative language
Project name in Czech
Změny v postranslačních modifikacích histonů po působení inhibitorů histon deacetyláz a po indukci buněčné diferenciace
Annotation in Czech
Postranslační modifikace histonů představují důležité epigenetické faktory, které hrají významnou úlohu v regulaci řady buněčných funkcí. Vybrané epigenetické modifikace histonů, společně s variantami heterochromatického proteinu HP1 budou v naší laboratoři zkoumány po působení inhibitorů histon deacetyláz (HDACi), které mají rovněž schopnost indukovat specifickou diferenciační dráhu a apoptózu. Během experimentálně navozených dějů bude hodnoceno 3D- uspořádáním vybraných struktur chromatinu v interfázních jádrech. Uvedené strukturální parametry budou testovány u různých buněčných typů. Dané analýzy chceme rovněž provádět na vybrané linii lidských embryonálních kmenových buněk. Zaměříme se převážně na studium H3(K9), H3(K4), H3(K27) di-methylace, H3(K9) acetylace a na analýzy HP1 (alfa, beta a gama) proteinů. Rovněž se budeme věnovat dynamice histonu H1 v interfázních jádrech živých buněk indukovaných HDACi do specifické diferenciační dráhy. Závěrečné experimenty budou věnovány
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
We have studied the post-translation histone modifications that are considered as an important epigenetic factors playing specific role in variety of cellular functions. Select histone modifications and heterochromatin protein 1 (HP1) sub-types have been
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Oct 22, 2009
Finance
Total approved costs
1,878 thou. CZK
Public financial support
1,878 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK