Plant H3-H4 histone chaperone networks
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D
Call for proposals
—
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
MSMT–7125/2020-12
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární dráhy H3-H4 histonových chaperonů u rostlin
Annotation in Czech
Naším cílem je získat přehled o mechanismech, které řídí dynamiku histonů prostřednictvím specializované molekulární sítě histonových chaperonů. Bylo prokázáno, že histonové chaperony specificky zpracovávají jednotlivé histonové varianty, čímž je regulována organizace transkripce chromatinu. Cílem projektu je proto navázat aktivní spolupráci mezi skupinami Dr. Probst a Dr. Dvořáčkové prostřednictvím krátkých pracovních cest a společně se zaměřit na významnou vědeckou otázku, a to: jaká je úloha histonových chaperonů při dynamice histonů, regulaci transkripce a při reakcích rostlin na změny vnějšího prostředí. V projektu budeme využívat experimentální materiál dostupný v partnerských laboratořích. Jedná se o rostlinné linie Arabidopsis thaliana, které obsahují značené verze H3-H4 chaperonů ASF1a a ASF1b a dvou variant histonu H3. Mimo jiné se také zaměříme na identifikací nových faktorů schopných interagovat s histonovými chaperony, což nám umožní odkrýt význam interakčních proteinových drah a jejich roli v transkripční regulaci a udržování epigenetických informací. Naše studie je založena na několika hlavních pilířích (i) využívání biologických nástrojů, které nám umožní nahlédnout do role histonových chaperonů v dynamice variant H3, (ii) využití zavedených technik v partnerských laboratořích umožňujících analýzu organizace chromatinu, transkriptomu, rozložení histonových variant na celo-genomové úrovni a (iii) použití zobrazovacích metod a vyhrazených metod analýzy obrazu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - secondary branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project was implemented within the framework of the MOBILITY Activity, whose main objective is to establish and deepen contacts with foreign research institutions. Therefore, the partial outputs of the project are not evaluated by the evaluation committee, but the correctness and adequacy of the use of the provided funds are checked.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 24, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-8J-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
156 thou. CZK
Public financial support
156 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK