Molecular basis of Staufen-mediated 3'UTR function
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-08153S
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární podstata Staufen zprostředkované funkce 3'UTR
Annotation in Czech
Při srovnání genetické informace červa a člověka, nekódující část genomu obrovsky vzrostla, zatímco počet protein kódujících genů zůstal konstantní. Tento nárůst se týká i 3´UTR mRNA o průměrné délce 1,2 kb, plnící funkci při mRNA transportu, kontrole translace a rozpadu mRNA. Navzdory důležitosti 3´UTR pro prostorovou a časovou kontrolu genové exprese, molekulární podstata funkce 3´UTR je z velké části neprobádána. Budeme pracovat na určování struktury komplexů 3´UTR signálů se Staufen1 proteinem a ribozomem, jež regulují mRNA stabilitu. Pomocí několika vzájemně se doplňujících strukturně-biologických přístupů budeme objasňovat molekulárně biologickou podstatu Staufen proteinem zprostředkované funkce 3´UTR pro posttranskripční regulaci genové exprese a poskytneme tak nová vysvětlení, jak tato deregulace přispívá ke vzniku běžných nemocí jako rakovina nebo neurodegenerativní onemocnění.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
In this project, the structures of the complexes Staufen1 dsRBD 3/4 with the 3'UTR SMD sequence of ARF1 mRNA were solved (WP1). The goals of ambitious and difficult WP2 and WP3 focused on the structural analysis of the full-length Staufen1 and its interaction with the 3 'UTR and the ribosome were partially met. The results obtained should lead to the completion of these goals in the near future.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
11,281 thou. CZK
Public financial support
11,081 thou. CZK
Other public sources
195 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK