Identification and characterization of T. militinae gene responsible for wheat APR resistance against powdery mildew
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-11688S
Alternative language
Project name in Czech
Identifikace a charakterizace genu odpovědného za APR rezistenci pšenice vůči padlí travní introdukovaného z T. militine
Annotation in Czech
Rasově nespecifický gen resistence vůči padlí travní QPm.tut-4A byl identifikován na konci pšeničného chromosomu 4AL v owm169 - owm228 regionu. V citlivém kultivaru Chinese Spring je oblast 680 kbp dlouhá a obsahuje 71 predikovaných genů a jen 20 z nich má homologii s rezistentní T. militinae. V T. militinae je oblast 480 kbp dlouhá a obsahuje 73 predikovaných genů. Z těchto genů bylo 8 z retroelementů, 16 bylo hypotetických a necharakterizovaných genů, 12 patří k LRR-like genům, a 18 s přítomností konzervované proteinové domény. V předloženém projektu navrhujeme identifikaci kandidátního genu/genů pro tuto rezistenci a jejich charakterizaci na molekulární a fenotypové úrovni. Kandidátní geny budou identifikovány pomocí „TILLING“ populace v které bylo identifikováno 7 linií, u kterých došlo ke ztrátě rezistence. Chromosomy 4A z těchto linií budou sekvenovány. Gen, který má mutaci alterující funkci ve všech liniích je kandidátní a bude verifikován a pomocí „Transient Assay“ a „ knockout“ metod.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Mar 25, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
7,198 thou. CZK
Public financial support
6,316 thou. CZK
Other public sources
882 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK