Evolution and fate of endosymbiotic organelles in stramenopiles
Project goals
Stramenopiles are a large and diverse group of protists including many heterotrophs and a huge algal group, the ochrophytes. This proposal aims at improving the knowledge of evolution and function of mitochondria and plastids of stramenopiles. We will obtain new sequences of mitochondrial and plastid genomes and will perform their comparative and phylogenetic analyses. For selected species we will also sequence and analyse the nuclear genomes and transcriptomes. We will combine the new sequence data with results of experimental characterization of mitochondrial proteomes of a heterotrophic and an algal stramenopile, and will define the differences in mitochondrial biology between stramenopiles with and without a plastid. We will also study the proteome of the ochrophyte plastids with the aim to better document metabolic functions of this organelle and variation in plastid biology among ochrophyte lineages. We will obtain a robust scheme of relationships among main ochrophyte lineages and will test a hypothesis of an origin of the plastid of chromerids from an ochrophyte.
Keywords
evolutionplastidmitochondrionsecondary endosymbiosistertiary endosymbiosisplastid replacementphagocytosismyzocytosisStramenopilaBicosoecidaDevelopayellaOlisthodiscusVischeriaChromeraVitrellatranscriptomegenomephylogenomic analysis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-13458S
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce a osud endosymbiotických organel stramenopilů
Annotation in Czech
Stramenopila jsou jednou z největších a nejrozmanitějších skupin protistů. Vedle řady heterotrofních skupin zahrnují i obrovskou řasovou skupinu, ochrofyty. Navrhovaný projekt má za cíl zásadním způsobem zlepšit znalosti o evoluci a funkci endosymbioticky vzniklých organel stramenopilů, tj. mitochondrií a plastidů. Získáme nové sekvence mitochondriálních a plastidových genomů a provedeme jejich srovnávací a fylogenetické analýzy. U vybraných zástupců budeme sekvenovat a analyzovat rovněž jaderné genomy a transkriptomy. Získaná sekvenční data zkombinujeme s výsledky experimentální charakterizace mitochondriálních proteomů heterotrofního a řasového zástupce stramenopilů a pokusíme se definovat rozdíly v biologii mitochondrií starmenopilů s plastidem a bez něj. Podobně budeme rovněž studovat proteom plastidu ochrofytů s cílem lépe zdokumentovat metabolické funkce této organely a rozdíly v plastidové biologii u různých linií ochrofytů. Získáme robustní schéma příbuzenských vztahů mezi hlavními ochrofytními liniemi a budeme testovat hypotézu o vzniku plastidů chromeridů z ochrofytní řasy.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2020
Project status
—
Latest support payment
Mar 25, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/10:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
9,730 thou. CZK
Public financial support
8,657 thou. CZK
Other public sources
1,163 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
9 730 CZK thou.
Public support
8 657 CZK thou.
88%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Solution period
01. 01. 2018 - 31. 12. 2020