Fungal communities in the environment: exploring fungal ecology and biogeography using the combination of novel molecular markers and metaanalyses
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-26191S
Alternative language
Project name in Czech
Společenstva hub v prostředí: využití nových molekulárních markerů a metaanalýz pro výzkum ekologie a biogeografie hub
Annotation in Czech
Studium složení mikrobiálních společenstev se zásadně změnilo po nástupu metod sekvenace nové generace před několika lety. Od té doby byla publikována řada studií, využívajících tyto metodiky pro popis společenstev hub, a nové články stále přibývají. Bohužel, přes vysoký informační obsah shromážděných datových souborů se jejich využití obvykle omezuje na jednu původní studii a potenciál pro metaanalýzu těchto dat nebyl dosud využit. Dalším zásadním problémem jsou omezení, daná charakterem molekulárních markerů, používaných v současnosti pro studium společenstev hub. Předkládaný projekt má za cíl popsat distribuci hub v prostředí s využitím veřejně dostupných sekvenačních dat a metadat, cíleně rozšířit spektrum analyzovaných vzorků a experimentálně verifikovat validitu predikcí, získaných na základě těchto dat. Dalším cílem je návrh nových a validace tradičních molekulární markerů pro analýzu složení společenstev hub s cílem optimalizovat analýzu environmentálních vzorků.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10618 - Ecology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EH - Ecology - communities
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Mar 25, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
8,873 thou. CZK
Public financial support
8,840 thou. CZK
Other public sources
33 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK