Working from a distance: engineering allosteric control on PDZ3 domain selectivity from ZO-1 protein through chimera domain fusion
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-03488S
Alternative language
Project name in Czech
Ovládání na dálku: Alosterická kontrola selektivity PDZ3 domény ze ZO-1 proteinu v chimerických fúzních konstruktech
Annotation in Czech
Alosterická modulace funkcí proténových domén je v současnosti jeden z nejzajímavějších konceptů molekulární biologie. PDZ domény představují ideálního kandidáta na kterém se dá studovat mechanismus vazebné specificity ovlivňované synergií sousedících domén v multidoménových proteinech. Kombinace teoretických, strukturních a biofyzikálních metod je vhodným nástrojem pro takovou studii. Projekt si klade za cíl v první řadě porozumění alosterii PDZ domény ovlivňované sousedními doménami, související se strukturou, sbalováním, dynamikou a substrátovou specifitou. Tento efekt budeme zkoumat na fúzních dvoudoménových proteinech obsahujících doménu PDZ3 z lidské Zonula Occludens (ZO-1) a arteficiální doménu nepřítomnou v živých buňkách. Objasnění podstaty mechanismu ovlivnění substrátové specificity domény PDZ3 a její souvislost s charakterem, pozicí a velikostí sousední domény by dale mohlo pomoci při objasnění obecného principu doménové koevoluce.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Apr 30, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
11,055 thou. CZK
Public financial support
9,960 thou. CZK
Other public sources
1,095 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK